Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPBP07199 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPBP07199 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPBP07199 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPBP07199 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPBP07199 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPBP07199 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPBP07199 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPBP07199 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CENPBP07199 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CENPBP07199 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CENPBP07199 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CENPBP07199 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CENPBP07199 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CENPBP07199 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CENPBP07199 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CENPBP07199 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CENPBP07199 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CENPBP07199 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CENPBP07199 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPBP07199 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPBP07199 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPBP07199 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPBP07199 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CENPBP07199 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPBP07199 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPBP07199 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPBP07199 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPBP07199 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CENPBP07199 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CENPBP07199 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CENPBP07199 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CENPBP07199 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CENPBP07199 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CENPBP07199 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CENPBP07199 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CENPBP07199 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms