Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPIND1P05546 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPIND1P05546 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPIND1P05546 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms