Protein–RNA interactions for Protein: P05387

RPLP2, 60S acidic ribosomal protein P2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP2P05387 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPLP2P05387 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPLP2P05387 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPLP2P05387 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms