Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB2P05107 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGB2P05107 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms