Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHBGP04278 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHBGP04278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHBGP04278 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHBGP04278 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBGP04278 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBGP04278 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBGP04278 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms