Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOA1P02647 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOA1P02647 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOA1P02647 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOA1P02647 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOA1P02647 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOA1P02647 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOA1P02647 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOA1P02647 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOA1P02647 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOA1P02647 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOA1P02647 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOA1P02647 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOA1P02647 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms