Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SERPINA1P01009 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERPINA1P01009 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA1P01009 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms