Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINC1P01008 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINC1P01008 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms