Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MBD3O95983 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MBD3O95983 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MBD3O95983 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD3O95983 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD3O95983 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD3O95983 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD3O95983 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MBD3O95983 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MBD3O95983 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MBD3O95983 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MBD3O95983 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MBD3O95983 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MBD3O95983 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms