Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX58O95786 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX58O95786 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX58O95786 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX58O95786 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX58O95786 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX58O95786 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX58O95786 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX58O95786 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX58O95786 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX58O95786 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX58O95786 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX58O95786 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX58O95786 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX58O95786 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX58O95786 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX58O95786 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX58O95786 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX58O95786 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX58O95786 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX58O95786 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX58O95786 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX58O95786 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX58O95786 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX58O95786 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX58O95786 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX58O95786 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX58O95786 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX58O95786 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX58O95786 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms