Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4FO95754 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms