Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACSL3O95573 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSL3O95573 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms