Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC1O94876 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCC1O94876 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMCC1O94876 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCC1O94876 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms