Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNCGO76070 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCGO76070 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNCGO76070 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCGO76070 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCGO76070 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCGO76070 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCGO76070 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms