Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F6O75461 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2F6O75461 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2F6O75461 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2F6O75461 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F6O75461 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F6O75461 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms