Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMPCBO75439 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMPCBO75439 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms