Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRCH4O75427 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH4O75427 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms