Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPFIA3O75145 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PPFIA3O75145 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPFIA3O75145 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms