Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MITFO75030 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MITFO75030 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MITFO75030 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MITFO75030 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MITFO75030 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MITFO75030 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MITFO75030 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MITFO75030 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MITFO75030 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms