Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF4O60810 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF4O60810 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF4O60810 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms