Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEMFO60524 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEMFO60524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMFO60524 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMFO60524 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEMFO60524 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEMFO60524 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEMFO60524 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMFO60524 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMFO60524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMFO60524 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMFO60524 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEMFO60524 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMFO60524 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMFO60524 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMFO60524 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEMFO60524 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NEMFO60524 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEMFO60524 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEMFO60524 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEMFO60524 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMFO60524 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEMFO60524 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEMFO60524 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms