Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMPRSS11DO60235 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11DO60235 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms