Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXTL3O43909 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXTL3O43909 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms