Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK2O43353 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK2O43353 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms