Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMINO43313 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMINO43313 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMINO43313 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMINO43313 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMINO43313 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATMINO43313 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATMINO43313 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMINO43313 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMINO43313 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMINO43313 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMINO43313 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMINO43313 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMINO43313 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms