Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLOCKO15516 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms