Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTDSP2O14595 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSP2O14595 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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