Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DYNC1I1O14576 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DYNC1I1O14576 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DYNC1I1O14576 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DYNC1I1O14576 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DYNC1I1O14576 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms