Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP6CO00743 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP6CO00743 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms