Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFRD1O00458 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFRD1O00458 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms