Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2K7ER74 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC4-APOC2K7ER74 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms