Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
I3L3M4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
I3L3M4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
I3L3M4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
I3L3M4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
I3L3M4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
I3L3M4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
I3L3M4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
I3L3M4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
I3L3M4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
I3L3M4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
I3L3M4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
I3L3M4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
I3L3M4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms