Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HHLA1C9JL84 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HHLA1C9JL84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HHLA1C9JL84 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms