Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms