Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KIF28PB7ZC32 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KIF28PB7ZC32 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KIF28PB7ZC32 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms