Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-1B6SEH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERVV-1B6SEH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-1B6SEH8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms