Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
B4E1Z4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
B4E1Z4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
B4E1Z4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
B4E1Z4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4E1Z4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4E1Z4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4E1Z4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
B4E1Z4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4E1Z4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4E1Z4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4E1Z4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
B4E1Z4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
B4E1Z4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
B4E1Z4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
B4E1Z4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
B4E1Z4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
B4E1Z4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
B4E1Z4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
B4E1Z4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
B4E1Z4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
B4E1Z4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
B4E1Z4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
B4E1Z4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
B4E1Z4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4E1Z4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4E1Z4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4E1Z4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4E1Z4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B4E1Z4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms