Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms