Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A6NNZ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A6NNZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A6NNZ2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A6NNZ2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A6NNZ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNZ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A6NNZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A6NNZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A6NNZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms