Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT8L1PA6NM43 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCT8L1PA6NM43 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8L1PA6NM43 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms