Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23AA6NH52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23AA6NH52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23AA6NH52 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TVP23AA6NH52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TVP23AA6NH52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23AA6NH52 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms