Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERINC4A6NH21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms