Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPSLA2A3N6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms