Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0U1RQJ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A0U1RQJ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A0A0U1RQJ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms