Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A0A0J9YY99 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0J9YY99 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms