Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYJ7

TRAV8-3, T-cell receptor alpha variable 8-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAV8-3A0A0A6YYJ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms