Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms