Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms