Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRPF3Q9ULD4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms