Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF1Q9UH73 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms